При исполнении контракта, по которому ранее был получен аванс, можно принять к возмещению НДС с указанной предоплаты даже в случае, если с момента ее получения прошло более 3 лет (см. письмо Минфина от 07.05.2018 № 03-07-11/30585).
Согласно п. 8 ст. 171 НК РФ возмещению подлежат суммы НДС, исчисленные с полной или частичной оплаты за предстоящие поставки товара, оказание услуги или исполнение работ. При этом вычет налога производится с даты исполнения поставщиком обязательств по контракту, предполагающему внесение аванса. Сумма возмещаемого НДС определяется исходя из стоимости отгруженного товара, оказанной услуги или выполненных работ в счет ранее полученной предоплаты.
На основании этого финансовое ведомство приходит к выводу, что возмещение НДС, исчисленного с аванса, осуществляется в момент осуществления поставок по нему. При этом возмещение возможно и в том случае, когда с даты получения предоплаты до дня исполнения поставщиком своих обязательств прошло более 3 лет.